在日本战国时期,分属不同名称的忍者团体也暗中进行过角力。月夜星光下,伊贺忍者山手(三原政运饰)、阵内(柏原翔史饰)、老鼠等人在探查过程中不慎与对手相撞。一个巨大的火球让所有人都惊呆了。回到村子后,野马提在首领的指示下前往森林调查火球的真相。途中,他们遇到了同派的琳琳(肘威尔米卡饰)和他的同伴,他们一起走来。结果,在密林之中,伊贺忍者们遭到了不明生物的袭击。对方身手敏捷,速度快,杀伤力巨大,忍者接连被杀。野马提、金内、琳琳等人虽然侥幸逃脱,却不知道外星人正在肆意繁殖。一时间,伊贺村毒害惨重,亚马蒂等人也面临着前所未有的挑战……