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在经历了难以想象的磨难和磨难之后，艾伦叶卡（三浦春马饰）、阿明阿诺德（本乡宗太饰）等不同背景的年轻人终于成为了合格的调查团成员。他们奉命在城外进行第一次调查，却被可怕的巨人追杀，造成重大伤亡。为了救他的朋友，艾伦被一个巨人的口中杀死。没想到，在巨人的腹中，他体内的神秘基因苏醒了。化为巨人的艾伦大怒，以压倒性的力量击败了一波又一波的巨人。激战过后，艾伦恢复了原本的模样，他的异变也引起了政府的注意。昏迷中，沉睡已久的记忆悄悄地揭示了隐藏在艾伦身上的谜团和家庭所遭受的悲剧。当艾伦面临被处决的命运时，装甲巨人突然闯入，将他带走。在一个被打断的房间里，艾伦面对着Shikishima（HiroshiHasegawa饰）。关于巨人，关于调查组，关于这个世界的所有谜团都被揭开……
