该节目由J.J.的制片人二人组制作。艾布拉姆斯和布莱恩伯克。第二季的故事在第一季之后。芬奇（迈克尔·艾默生饰）被神秘的鲁特小姐绑架后，“西装男”约翰·里斯（詹姆斯·卡维泽饰）不得不求助。在纽约警察局凶杀科的侦探朋友卡特（塔拉吉·P·汉森饰）和福斯科（凯文·查普曼饰）的帮助下，经过仔细调查，终于找到了芬奇。获救，却被Root逃脱。看似恢复如初，实则暗藏危机。除了Root想把Finch的计划公之于众之外，他们还得找出HR的幕后黑手。另一方面，联邦调查局和中央情报局都在拼命寻找约翰。只要机器存在，这座城市似乎就不会让它们休息……
