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在繁华而时尚的忍者岛上,乐高反派们过着幸福而无忧无虑的生活,除了……每隔一段时间,他们就会受到邪恶恶魔贾曼杜(贾斯汀·塞鲁克斯配音)的入侵和骚扰。当然,多亏了勇敢无畏的幻影忍者,他们一次次挺身而出,与魔王作战,才将忍者岛从被邪恶统治的危险中解救出来。绿忍者劳埃德(戴夫佛朗哥戴夫佛朗哥饰)是卡曼杜的亲生儿子,不知道他忍者身份的市民经常嘲笑和辱骂劳埃德。郁闷的青年只好将怒火倾泻在以破坏为乐的加曼杜身上。又一次挫折后,加曼杜带着更强大的军团卷土重来。关键时刻,劳埃德激活了吴大师(成龙配音)使用的终极武器,阻止了终极武器的使用,最终给忍者岛带来了毁灭性的灾难。为了拯救忍者岛,幻影忍者穿越山河,甚至与加曼合作……