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在一个阳光明媚的日子，由铃木财团建造的铃木塔举行了盛大的开业典礼。柯南（高山南配音）和他的好朋友自然被邀请到访。不料，一名游客突然被远处建筑物射出的子弹击中身亡。柯南锁定了凶手，展开了果断追击。但对方胆子很大，公然炸毁了拦在他面前的警车，在重重掩护下逃走。之后，联邦调查局和日本警方组成联合调查总部，通过朱迪·斯特林（一条美雪配音）的介绍，嫌疑人很可能就是前美国海豹突击队狙击手蒂莫西·亨特。战功卓著的亨特曾获得过银星勋章，但后来被战友指责，枪杀手无寸铁的平民违反了战争原则。之后，他在战场上遭受了终生的创伤，人生彻底陷入了低谷。这一次，他以神秘狙击手的身份出现，显然是想为那些毁了他性命的人报仇雪恨。狙击事件接连不断，整个东京都陷入了极大的恐慌……
