22世纪末，名为“加米拉斯”的未知外星生物占领火星，不断向地球发射含有强放射性物质的行星炸弹，导致濒临灭绝的地球人死伤无数。，并被迫转入地下求生。危急关头，人类组建太空舰队，前往火星远征。结果，几乎全军覆没。侥幸逃脱的大和号成为了人类最后的希望。与此同时，一个神秘装置横跨千里之外的银河坠落地球。经过测试，发现该装置可以消除放射性物质。为了向装置的主人——麦哲伦云中的伊斯干达高智商寻求帮助，人类决定将所有的鸡蛋放在一个篮子里，派大和出征。在火星战役中失去兄弟的原宇宙舰队成员古津（木村拓哉饰）被召回队伍，一众小伙伴成为见证伟大历史时刻的一员。而得知人体动作的加米拉斯，也展开了一波又一波的致命攻击……本片改编自松本零二的同名原著。
