奥特战士的故乡——M78星云“光之国度”突然遭到神秘敌人袭击，年轻的战士零号奥特曼对自己的力量过于自信，一度陷入危机。在父亲七号奥特曼的帮助下，零号奥特曼成功突围，歼灭敌人。为了弥补自己的草率，零号奥特曼独自承担了查明敌人真实身份的任务。带着父亲送给他的万能物品——赛罗手环，他独自踏上了前往未知宇宙的旅程。经过艰苦的旅程，零号奥特曼到达了一个星球。在一个被巨型机器人军队蹂躏的星球上营救人们时，他遇到了一个受重伤并濒临死亡的年轻人Arashi和他的弟弟Zhi。零号奥特曼被岚的勇气所感动，与他融合，化身为人形，救了岚一命。之后，零号奥特曼通过与埃斯梅拉达星球埃梅拉娜公主的会面，得知了敌人的真实身份……操纵谜一样的敌军的幕后黑手是“银河皇帝贝利·爱西亚”！邪恶的奥特战士贝利亚，被奥特战士联手击败的他复活了！他建立了强大的银河帝国，踏上了称霸宇宙的征程！与岚为一的零奥特曼为了粉碎贝利亚皇帝的野心，穿越到浩瀚宇宙与小智和埃梅拉娜公主一起乘坐宇宙飞船——皇家飞船!挑战恶魔银河帝国的零式奥特曼和他的朋友们，等待着他们的将是什么……?
