美国纽约这个繁华的大都市，以邪恶首领施拉德为首的大脚怪帮派在城市中为非作歹，十分猖獗。安保公司老板埃里克·萨克斯（威廉·菲希特纳WilliamFichtner饰）推出ZUI新安保系统，誓要维护城市的和平。Channel6女记者AipurO'Neill（梅根·福克斯MeganFox饰）无意中拍到了大脚帮被四名神秘骑士打败的画面。就是变异的巴西龟：拉斐尔、莱昂纳多、米开朗基罗、多纳泰罗。忍者神龟的名字勾起了阿普丽尔童年的回忆，当时她的父亲和萨克斯是生物突变实验研究的伙伴。她向萨克斯报告了这个消息，但在与忍者神龟和他的老师斯普林特会面后，她意识到萨克斯和施拉德才是这座城市的罪恶之源……本片根据同名经典漫画改编。
